امام جمعه بوشهر تاکید کرد: ترور شهید فخری زاده همانند دیگر ترور‌های شخصیت‌های انقلاب،دلیل روشنی بر تروریسم دولتی امریکا و رژیم صهیونیستی و مظلومیت ایران اسلامی است.
امام جمعه مسجد مکی و مدیر حوزه علمیه دارالعلوم اهل سنت زاهدان با صدور بیانیه‌ای ترور محسن فخری‌زاده را ناجوانمردانه و ظالمانه توصیف و این اقدام را به شدت محکوم کرد.