پرونده میکونوس، تجربه‌ای ارزشمند و موفقیت آمیز برای ایران در مقابل کشور‌های غربی است و برای اروپا نیز به نقطه برای بازنگری در شیوه مواجه با ایران تبدیل شد.
شماری از نمایندگان کنگره آمریکا در نامه‌ای به مدیران شرکت هواپیماسازی بوئینگ و در ادعایی از آنها خواستند امنیت آمریکا را بر منافع خود ترجیح دهند و با ایران وارد معامله نشوند.