بسیاری از انواع رژیم‌های غذایی، سبک زندگی و سایر عوامل محیطی می‌توانند بر روی باکتری‌های روده انسان تاثیر منفی داشته باشند.
روده انسان حاوی بیش از ۱۰¹⁴ باکتری است که به عنوان فلور روده شناخته می‌شوند.
داشتن فلور روده سالم با عملکرد طبیعی و نرمال برای سلامت کلی بدن انسان بسیار مهم است.
صد‌ها گونه از انواع باکتری‌ها در روده شما زندگی می‌کنند. برخی از آن‌ها برای روده مفید و برخی دیگر مضر هستند. باکتری‌های روده‌ای برای فرآیند هضم و جذب بسیار مهم هستند. آن‌ها باکتری‌های مضر و میکروارگانیسم‌های مهاجم را از بین می‌برند و باعث تولید ویتامین K، فولات و اسید‌های چرب کوتاه زنجیر می‌شوند.
هنگامی که تعادل باکتری‌های روده به هم می‌خورد، شمار باکتری‌های مضر افزایش می‌یابند و پس از آن که باکتری‌های مفید کاهش پیدا کنند، شرایطی به نام دیس بیوزیس (dysbiosis) به وجود می‌آید.
به بعضی از عوامل که باعث از بین رفتن باکتری‌های مفید روده می شوند، اشاره می‌کنیم:
۱. وجود نداشتن تنوع در انواع مواد غذایی دریافتی بدن
۲. انجام ندادن فعالیت بدنی منظم
۳. استفاده بیش از حد از آنتی بیوتیک
۴. استعمال سیگار
۵. مصرف مشروبات الکلی
۶. خواب ناکافی
۷. استرس بیش از حد
۸. کمبود پروبیوتیک در مواد غذایی