دبيركل مجمع نخبگان ايران در پيام تسليتي به مناسبت رحلت حضرت آيت ا.. مهدوي كني (ره) با اشاره به خدمات ماندگار آن عالم رباني به جامعه علمي كشور تاكيد كرد: جامعه علمي و نخبگان كشورمان هرگز خدمات اثر بخش و وحدت آفرين وي در پيوند بين حوزه و دانشگاه را فراموش نخواهند كرد.
ستاد نماز جمعه تهران با صدور پیامی ضمن تسلیت درگذشت آیت‌الله مهدوی کنی، تأکید کرد: یقینا خدمات خالصانه این شاگرد مکتب امام صادق (ع) از یاد و خاطره ملت شریف ایران نخواهد رفت.