محمود احمدی نژاد رئیس جمهور کشورمان در نشست خبری پس از دیدار با شیخ الازهر درحالی که نماینده الازهر تلاش داشت تا با طرح برخی اظهارات اختلاف افکنانه مذهبی مسائل مربوط به شیعه و سنی را مطرح کند، به این اظهارات واکنش نشان داد.احمدی نژاد به هیئت مصری هشدار داد در صورت ادامه این اظهارات اختلاف افکنانه جلسه را ترک می‌کند که در این لحظه یکی از همراهان سخنگوی شیخ الازهر به وی موضع رئیس جمهور کشورمان را اعلام کرد.
رييس جمهوري اسلامي ايران با بيان اينكه در ديدار رييس و اساتيد الازهر مسائل مهم منطقه و جهان اسلام را مورد بررسي و تبادل نظر قرار داديم، اظهار داشت: براي اصلاح وضع جهان و منطقه ديدگاه هاي مشترك و نزديكي با يكديگر داريم.
حسن الشافعی از اعضای هیئت علمای ارشد و مدیر دفتر شیخ الازهر ، مطالبی جنجالی در خصوص شیعیان و اهل سنت بیان کرد که با اعتراض دکتر احمدی نژاد لحن سخنان خود را تغییر داد.
در میان موافقت مشروط کانون قضات شورای دولت مصر با نظارت بر همه پرسی پیش نویس قانون اساسی، دانشجویان دانشگاه الازهر هم به هواداران محمد مرسی رئیس جمهور مصر و پیش نویس قانون اساسی پیوستند.
در رویکردی که آشکارا از تاثیر گروه های سلفی و تکفیری بر بزرگ ترین مرکز آموزش علوم اسلامی در جهان تسنن حکایت دارد، الازهر براي اولين بار از زمان تأسيس، جلساتي را با حضور علماي مشهور خود براي جلوگيري از "گسترش مذهب تشيع" برگزار مي كند.