آیت‌الله جوادی آملی گفت: حکیم و عارف گران سنگی مانندمرحوم آیت‌الله حسن‌زاده آملی، راه عقل و راه شهود را به خوبی پیمود و توانست هم به فیض علمی برسد و هم فیض و فوز خدا را دریافت کند.
آیت‌الله فاضل‌لنکرانی در پیامی به مناسبت درگذشت آیت‌الله حسن‌زاده آملی ،از توجه عمیق به قرآن و تفسیر آن به عترت و فهمیدن متون حدیثی نظیر اصول کافی و تلاش در احیاء تدریس متون فلسفی را از ویژگی‌های بارز او دانسته است.