برخلاف تصور برخی، عمر سقاخانه اسماعیل‌طلایی، نسبت به دیگر بنا‌های صحن عتیق، کمتر است. ضلع جنوبی صحن در دوره تیموری بنا شد و هنوز کتیبه سلطان‌حسین بایقرا بر اطراف ایوان طلا چشم‌نوازی می‌کند
مرقد مطهر امام رضا (ع) دارای حجمی مکعب صندوقی شکل است، برخی مورخان عقیده دارند که پس از دفن امام رضا (ع) روی قبر مبارک ایشان علامت و صندوقی گذاشته‌اند.