سازمان فرهنگ و ارتباطات اسلامی در پیامی شهادت دکتر محسن فخری‌زاده، دانشمند هسته‌ای ایران را به محضر مقام معظم رهبری (مد ظله العالی) و همه مسلمانان تسلیت گفت.
امام جمعه مسجد مکی و مدیر حوزه علمیه دارالعلوم اهل سنت زاهدان با صدور بیانیه‌ای ترور محسن فخری‌زاده را ناجوانمردانه و ظالمانه توصیف و این اقدام را به شدت محکوم کرد.
براساس اظهار نظرهای مسئولان آمریکایی و اسرائیل و نیز توئیت دونالد ترامپ اینگونه برداشت می شود که ترور فخری زاده یک عملیات مشترک آمریکایی اسرائیلی بوده است.
ایران در طول قرن ها فداییان زیادی را در دل خود پرورانده و این فداییان نیز چه نیکو پاسخی در خور شان مام میهن داده اند و خود را برای عزت این سرزمین فدا کرده اند. شهید مصطفی یکی از این آدمهاست در این نزدیکیها که در طول مدت کوتاه ولی پر ثمر خود ردپایی سفت ومحکم از خود بجا گذاشت.