در اثر سو مدیریت و عدم نگهداری صحیح متولیان امر، تخریب و افتادگی کاشی‌ها، شکسته شدن پنجره‌های چوبی، تخریب سنگ فرش و کاشی کف، از بین رفتن نقش‌ی برجسته‌ها، یادگاری نویسی، و شکسته شدن گنبد، حیات این مسجد با شکوه و با عظمت  در آستانه ویرانی قرار گرفته است. اگر توجه جدی به مرمت و نگهداری این مسجد نشود، اصفهان یکی از زیباترین بنا‌های تاریخی خود را به عنوان یک جاذبه گردشگری از دست خواهد داد.