رهبر معظم انقلاب اسلامی حضرت آیت الله خامنه‌ای عصر دوشنبه ۶ بهمن ۱۳۹۹ با خانواده دانشمند برجسته هسته‌ای و دفاعی کشور، شهید محسن فخری‌زاده دیدار کردند. رهبر انقلاب اسلامی، ضمن تقدیر از این شهید، عظمت یافتن نام شهید فخری‌زاده در میان عموم مردم و ابراز تأسف بسیاری از جوانان از ناشناخته بودن او در زمان حیاتش را از دیگر آثار اخلاص شهید دانستند.