پوشش ضريح مطهر و پرچم گنبد بارگاه ملكوتي ثامن‌الحجج(ع) در اعياد و شهادت‌ها تعويض مي‌شود، یعنی: در ايام شهادت رنگ پرچم و پوشش ضريح مشكي و در اعياد و ميلاد ائمه هدي(ع) پوشش و پرچم به رنگ سبز است. قدمت و پيشينه برگزاري مراسم تعويض پرچم را مربوط به دوران صفوي دانست والبته اين آئين در طول تاريخ، داراي فراز و نشيب‌هاي مختلفي بوده است، ولي شكل فعلي اجراي آن، از ابتداي پيروزي انقلاب اسلامي آغاز شده است