در پیام حجت الاسلام و المسلمین محمد علی نکونام در پی شهادت رئیس جمهور و همراهانش آمده است:

"بسم الله الرّحمن الرّحیم
اِنّا لِله و اِنّا اِلَیهِ راجِعون
شهادت پرافتخار و تحول آفرین و جانسوز رئیس جمهور عزیزمان و همراهانشان را تبریک و تسلیت می‌گویم.
خدایا تو می‌دانی سیدی از میان ما رفت که برای خدمت به دین تو و برای خدمت به انقلاب اسلامی از هیچ تلاشی دریغ نداشت. سیدی که امید این ملت بود؛ سیدی که دل در گرو اولیائت بویژه حضرت ثامن الحجج علیه السلام داشت؛ سیدی که مفتخر به خادمی آستان قدس رضوی بود و سند افتخارش هم آنکه در ایام منتسب به آن حضرت آسمانی شد؛ سیدی که امروز به اجداد طاهرینش پیوست اما با کارنامه‌ای درخشان، کارنامه‌ای پر از خدمت و معرفت و عبادت.
امروز امت اسلامی ایران مصیبت عظمائی را تجربه می‌کند، خدایا صبر در این مصیبت را عطایمان فرما. 
سید ابراهیم رئیسی تنها رئیس جمهور نبود او به تنهائی یک امت بود، او از خود درسها برای آینده به یادگار گذاشت.
او خدمت را به معنای راستینش معنا کرد، او سید محرومان و سیدالشهدای خدمت شد؛ او تبعیت از ولایت را در حرف و عمل به اثبات رساند، او با نگاه جمع الجمعیش همه را در سیر واحد حرکت قرار داد.
اظهار نگرانی از زمان حادثه تا زمان اعلام شهادت توسط اقشار مختلف و طیفهای گوناگون سیاسی حاکی از همین نگاه جمع الجمعی اوست که راه رسیدن به قله‌های انقلاب است.
آیه الله سید ابراهیم رئیسی به حق عالمی بود که رفتنش ثلمه‌ای جبران‌ناپذیر در اسلام عزیز است؛ او عالمی مجاهد، بی اعتنا به مظاهر دنیوی و دل در گرو خدایش داشت لذا اخلاصی مثال زدنی در کارها و بر زندگیش حاکم بود. 
بار دیگر شهادتش و شهادت همراهانش وزیر محترم خارجه و نماینده محترم ولی‌فقیه در استان آذربایجان شرقی و استاندار محترم را تسلیت می‌گویم و حشر با اولیاء الهی را برایشان مسألت دارم."

پیام تسلیت سپاه قمربنی هاشم (ع) در پی شهادت رئیس جمهور

سپاه حضرت قمربنی هاشم (ع) با صدور پیامی به مناسبت شهادت آیت الله ابراهیم رئیسی و هیئت همراه، شهادت خادمان ملت را پاداش خدمت خالصانه در مسیر نورانی انقلاب و ولایت دانست.

در متن پیام آمده است:
شهادت خادمان ملت رویش‌های انقلاب را مضاعف می‌کند.

مِنَ المُؤمِنینَ رِجالٌ صَدَقوا ما عاهَدُوا اللَّهَ عَلَیهِ فَمِنهُم مَن قَضی نَحبَهُ وَمِنهُم مَن یَنتَظِرُ وَما بَدَّلوا تَبدیلًا؛ در میان مؤمنان مردانی هستند که بر سر عهدی که با خدا بستند صادقانه ایستاده‌اند؛ بعضی پیمان خود را به آخر بردند (و در راه او شربت شهادت نوشیدند) و بعضی دیگر در انتظارند و هرگز تغییر و تبدیلی در عهد و پیمان خود ندادند. (سوره مبارکه الأحزاب آیه ۲۳)

شهادت خادم الرضا، خدمتگزار صدیق محرومان، آیت‌الله سید ابراهیم رئیسی، رئیس جمهوری اسلامی ایران به همراه هیئتی در راه خدمت به مردم در سانحه هوایی بالگرد در منطقه «ورزقان» آذربایجان شرقی را محضر حضرت ولی عصر (عج)، مقام معظم رهبری و ملت بزرگ ایران و دوستداران انقلاب در اقصی نقاط جهان تبریک و تسلیت می‌گوییم.

عظمت راه مقدس خون شهید را فقط شهدا درک می‌کنند و باید در قرآن کریم و سیره معصومین علیهم السلام جستجو کرد که خداوند متعال می‌فرماید: «ولاتحسبن الذین قتلوا فی سبیل الله امواتا بل احیاء عند ربهم یرزقون».

به مصداق فرمایشات بنیانگذار کبیر انقلاب حضرت امام خمینی (رحمت الله علیه)، با رفتن شهدا، خدای تبارک و تعالی شما را پشتیبانی می‌کند و شما قوی خواهید بود؛ و به تعبیر مقام معظم رهبری حضرت آیت الله العظمی امام خامنه‌ای (مدظله العالی)، «ملت ایران نگران و دلواپس نباشند، هیچ اختلالی در کار کشور به وجود نمی‌آید و ان‌شاءالله همه کار‌ها اعم از امنیت کشور و امنیت مرز‌ها و امور مربوط به قوه مجریه مرتب و منظم انجام خواهد شد و پیش خواهد رفت».

قطعا شهادت نقطه قوت برای مسیر نورانی انقلاب و اسلام و ولایت است و در مکتب ما با شهادت کار تازه شروع می‌شود و شهیدان چراغ راه آیندگان خواهند بود و شهادت خادمان ملت رویش‌های انقلاب را مضاعف می‌کند.

ما پاسداران و بسیجیان سپاه حضرت قمربنی هاشم (ع) استان چهارمحال و بختیاری با ابراز تأثیر عمیق از شهادت خادمان ملت بویژه رئیس جمهورمحبوب آیت الله ابراهیم رئیسی و همراهان شهیدش، آمادگی خود را برای پشتیبانی همه جانبه از دولتمردان در ادامه مسیر خدمت به مردم و حفظ امنیت همه جانبه کشور اعلام می‌داریم.

بیانیه تسلیت شورای هماهنگی تبلیغات اسلامی چهارمحال و بختیاری در پی شهادت رئیس‌جمهور

شورای هماهنگی تبلیغات اسلامی چهارمحال و بختیاری در پی شهادت رئیس‌جمهور پیام تسلیت صادر کرد.

در این پیام آمده است:
انالله و اناالیه راجعون

اللَّهُمَّ إِنَّا لَا نَعْلَمُ مِنْهُ إِلَّا خَیْرا

روح بلند رئیس جمهور محبوب دولت مردمی، خادم‌الرضا حضرت آیت‌الله سید ابراهیم رئیسی و همراهان خدمتگزارِ خدوم و شریف ایشان حسین امیرعبداللهیان وزیر امور خارجه، حجت‌الاسلام‌ والمسلمین آل‌هاشم نماینده ولی فقیه و امام جمعه، مالک رحمتی استاندارآذربایجان شرقی، سرتیم حفاظت رئیس جمهور سردار سرتیپ موسوی و سایر همراهان، ضایعه‌ای اسفبار و مایه‌ی تألم مردم ایران اسلامی است.

«شهید جمهور» آیت‌الله رئیسی(رحمه الله علیه)، سالک متواضع، خادم برجسته‌ی ملت و مجاهد پرتلاش و انقلابی در شب میلاد حضرت علی‌‌ابن‌ موسی‌الرضا(علیها السلام) میهمان امام رئوف شد؛ بزرگ مردی که مظلومیت و شهادت را از استادش شهید بهشتی به ارث برد و پرونده خدمت خود را که در حیات انقلابی و سیاسی و فرهنگی ایران، منطقه و جهان نقش پر رنگی داشت؛ با مدال سیدالشهدای خدمت به پایان رساند.

شورای هماهنگی تبلیغات اسلامی این حادثه‌ی مولمه را به پیشگاه حضرت صاحب‌الزمان (عجل‌لله تعالی فرجه الشریف) و زعیم حکیم امت رهبر معظم انقلاب اسلامی(مدظله‌‌‌العالی)، بیت مکرم و بستگان آن فقید رستگار و همه ملت شریف ایران اسلامی تسلیت عرض نموده و علو درجات این شهیدان والامقام را از خداوند متعال مسئلت دارد.