اولین جلسه فراکسیون روحانیت مجلس دوازدهم برای تعیین اعضای هیئت رئیسه تشکیل شد و بر این اساس، حجت الاسلام مرتضی آقاتهرانی به عنوان رئیس این فراکسیون انتخاب شد.
همچنین حجت الاسلام علیرضا سلیمی به عنوان نایب رئیس اول، حجت الاسلام محمدتقی نقدعلی به عنوان نایب رئیس دوم، حجت الاسلام نصرالله پژمانفر به عنوان سخنگو و حجت الاسلام قاسم روانبخش به عنوان دبیر فراکسیون روحانیت انتخاب شدند.