در طرح جایگزینی خودرو‌های فرسوده گروهی شکایت کردند که خودروی خود را اسقاط کردند، اما درگاه خودروساز برای پرداخت مبلغ خودرو برایشان باز نشده بود.
در این زمینه آقای مهران سالاریه رئیس ستاد نوسازی ناوگان و اسقاط خودرو‌های فرسوده گفته بود به دلیل انتقال فرآیند انجام کار از ستاد حمل و نقل سوخت به ستاد نوسازی ناوگان و اسقاط خودرو‌های فرسوده روند اجرای کار این دسته متقاضیان به تاخیر افتاد.
پس از پیگیری‌ها از این سامانه، سایت برای تمام متقاضیانی که در طرح جایگزینی برنده شده بودند باز شد؛ اما همچنان برخی متقاضیان مشکل داشتند. در مجموع حدود هزار و ۳۰۰ نفر موفق به واریز وجه برای پرداخت هزینه خودرو به خودروساز نشدند.
در پی ایجاد نارضایتی در میان متقاضیان طرح جایگزینی خودرو‌های فرسوده به دلیل تاخیر در اجرای این طرح، ایران‌خودرو اعلام کرد تاخیر در معرفی نفرات واجد شرایط به مراکز اسقاط علت اصلی این نارضایتی است که خارج از ایران‌خودرو بوده است.
فرآیند اسقاط خودرو در اختیار ایران‌خودرو نبوده و طولانی شدن این فرآیند سبب مواجه شدن مشتریان با موضوع مجوز شماره گذاری محصولات شده است.
در اعلام اخیر طرح جایگزینی خودرو‌های فرسوده که حدود ۲۵ روز گذشته بوده تعداد ۱۳۰۰ متقاضی معرفی شده اند و ایران‌خودرو به محض دریافت مشخصات، متقاضیان را در نوبت تحویل خودرو قرار داده و براساس واریز وجه نسبت به تحویل خودرو به مشتریان اقدام خواهد کرد.