نصب و راه اندازی بیوراکتور‌های خط تولید صنعتی واکسن‌ها و کشت سلول‌های جانوری، تولید کیت غربالگری آبله میمونی، تولید و توزیع کیت تشخیص همزمان آنفلوانزا و کووید ۱۹ و کیت تشخیصی غربالگری واریانت امیکرون از اقدامات انستیتو پاستور ایران در دولت سیزدهم بوده است.
انستیتو پاستور ایران در دولت سیزدهم موفق به تولید بیش از ۱۶ میلیون دوز واکسن پاستوکوک و پاستوکوک پلاس شد.
همچنین اولین سری ساخت واکسن هاری دامی در دولت سیزدهم با تلاش‌های مستمر بخش تولید واکسن‌های ویروسی، پس از بهینه سازی فرایند غیر فعال سازی ویروس درحدود ۲۰ هزاردوزتولید شد.
در دولت سیزدهم اولین واکسن‌های صادراتی انستیتو پاستورایران در بعداز پیروزی انقلاب اسلامی، به مقدار ۲۰۰ هزاردوز واکسن ب ث ژ و ۲۰۰ هزار دوز واکسن هپاتیت ب به کشورونزوئلا صادر و فروخته شد.