بخش‌های جشنواره سینما حقیقت عبارتند از مسابقه ملی، مسابقه بین‌الملل، جایزه شهید آوینی، بخش‌های جنبی ملی و بین‌الملل و بزرگداشت.
در بخش ملی آثاری می‌توانند متقاضی حضور در جشنواره باشند، که بعد از فروردین ۱۴۰۰ تولید شده باشند. دو تقدیر هم در شانزدهمین جشنواره «سینماحقیقت» انجام خواهد شد. شروع ثبت نام و ارسال لینک برای حضور در جشنواره «سینماحقیقت»، از ۲۷ تیرماه است.
مرکز گسترش سینمای مستند، تجربی و پویانمایی شانزدهمین دوره جشنواره بین‌المللی فیلم مستند ایران «سینماحقیقت» را آذرمـاه ۱۴۰۱ به صورت حضوری و همچنین نمایش برخط (آنلاین) به شکل رقابتی برگزار خواهد کرد.