متن نامه مرجع تقلید شیعیان به آیت الله اعرافی، مدیر حوزه‌های علمیه به این شرح است:سفر جنابعالی به واتیکان اولین رابطه رسمی بین حوزه علمیه قم و مسیحیت کاتولیک است.
شخصیت پاپ نسبت به سلف خود ممتاز است و در سفر خود به عراق و دیدار با آیت‌الله سیستانی مطالبی را بیان کرد که می‌توانست نگوید؛ این حاکی از آن است که شخصیت محافظه‌کاری نبوده بلکه به واقعیات تا حدودی علاقه‌مند است.
آیت‌الله سبحانی با بیان اینکه همکاری علمی و آکادمیک و تبادل استاد و دانشجو تا حدی مناسب است،گفت: بهترین پیشنهاد، تالیف دایرةالمعارف با حجم کم در حوزه مسائل مشترک کلامی است؛ البته کار‌های علمی مشترک مانند حقوق کودک و خانواده و محیط زیست بسیار ناسب برای گفتگو است.
دعوت هیئت‌های علمی از آنان و بازدید از مراکز حوزه علمیه مناسب است.