همه بیمارستان‌های اهواز به منظور مدیریت پسماند‌های عفونی، برای حمل پسماند‌های بی خطر سازی شده خود با سازمان پسماند شهرداری اهواز دارای قرارداد هستند.
همچنین بر اساس شیوه نامه‌های وزارت بهداشت و سازمان حفاظت محیط زیست، مدیریت و پایش عملکرد کیفی دستگاه‌های بی خطر ساز بیمارستانی از سوی آزمایشگاه‌های معتمد سازمان محیط زیست انجام و صحت عملکرد این دستگاه‌ها به صورت مرتب ارزیابی می‌شود.
در ادامه فرآیند مدیریت پسماند، پسماند‌های بی خطر شده به منظور دفن بهداشتی تحویل سازمان پسماند شهرداری اهواز می‌شوند و شهرداری حمل و نقل و دفن آن‌ها تا سایت دفن زباله را انجام می‌دهد.