بنای امامزاده دارای پلان مربع مستطیل است بقعه ی اصلی که قدیمی ترین بخش مجموعه است پشت سر فضای هشتی قرار دارد این قسمت از نمای بیرونی مربع مستطیل، ولی از بخش داخلی، هشت ضلعی است.
پوشش سقف اتاق آرامگاه از نوع گنبد پنج او هفت
کند است. در مجموع فضای بقعه از 7 بخش مجزا تشکیل شده است.
پشت سر بقعه ی اصلی، اطاق بزرگی با پلان مستطیلی با ابعاد 5/12 متر طول و 7متر عرض واقع شده که کاربری مسجد را دارد.
مجموعه ی امام زاده يعقوب به جهت توجه و عنايت مردمي از رونق زيادی برخوردار است و هجوم زائرين موجبات گسترش فضاهاي عمومي ، زائرسرا ، كشتارگاه و بالاخره آشپزخانه در اين مجموعه گردیده است.
گفتنی است در رابطه با شجره نامةی آن حضرت اختلاف نظر وجود دارد چرا که برخی ایشان را ازاحفاد و نوادگان حضرت امام جعفر صادق(ع) دانسته اند ولی برخی دیگر بر این عقیده اند که امام زاده يعقوب (ع)، از اولاد بلا فصل امام موسي بن جعفر(ع) می باشد.
از همه هموطنان که قصد سفر به شهر ما رادارند دعوت میکنیم که حتما به این بنای مذهبی که در بالای تپه در شهر صائين قلعه قرار گرفته رفته تاعلاوه برزیارت ، سیاحتی هم از این شهر وامامزاده داشته باشند./ع