پس از آوردن سر مطهر امام حسين عليه السلام به همراه ساير سرهاى شهداى كربلا عليه السلام، سر مطهر آن حضرت را به مدت سه روز در اتاقكى در گوشه شمال شرقى مسجد قرار دادند.
با حمایت سلفی‌ها و وهابیون مصر پلیس مصر از برگزاری مراسم عاشورا در مسجد راس الحسین (علیه السلام) قاهره ممانعت به عمل آورد. به نوشته پایگاه خبری الوفد پلیس منطقه جمالیه قاهره در مقابل درب اصلی مسجد اقدام به بازرسی و تفتیش افرادی که قصد ورود به مسجد راس الحسین (علیه السلام) را داشتند کرد و اجازه ورود شیعیان مصر به این مسجد را نداد.