بر اساس مصوبه ستاد ملی مبارزه با کرونا و اجرای طرح فاصله گذاری اجتماعی در کشور، این طرح در فرودگاه مهرآباد نیز آغاز شده و سالن‌های ترمینال مسافری برای اجرای طرح فاصله گذاری اجتماعی علامت گذاری شدند. همچنین صبح یکشنبه ۳۱ فروردین سال ۱۳۹۹ ضدعفونی سالن‌های فرودگاه انجام شد.
رضا جعفرزاده سخنگوی سازمان هواپیمای کشوری در گفتگو با باشگاه خبرنگاران جوان، با بیان اینکه تمام پروازهای فرودگاه مهرآباد به دلیل وضعیت بد جوی آب‌وهوا و کاهش شدید دید با تأخیر انجام می‌شود و برخی از مقاصد هم پروازهایشان کنسل شده است، گفت: تمامی پروازها هم‌اکنون متوقف شده است و در حال حاضر منتظر هستیم تا با بهبود شرایط وضعیت آب‌وهوا بعضی پروازها انجام شود. او تأکید کرد: باند فرودگاه مهرآباد مشکلی برای نشست و برخاست ندارد اما آنچه که در این شرایط مهم است، وجود دید کافی است که به دلیل برودت هوا و نبود دید کافی برای خلبان‌ها امکان پرواز به هیچ عنوان وجود ندارد.